OBIETTIVI E CONTENUTI

OBIETTIVI FORMATIVI

Modulo “Strumentazione in Genomica e Proteomica”

Strumentazione in Genomica: Trattazione delle principali tecnologie applicate all’analisi genomica sia a livello di cromosomi sia a livello di sequenza del DNA.

Strumentazione in Proteomica: Il corso intende fornire le basi per la comprensione delle tecniche di spettrometria di massa utili alla caratterizzazione strutturale di proteine.

Tecniche Cromatografiche: Questa parte di corso si propone di fornire una trattazione aggiornata sui metodi di preparazione del campione e sulle tecniche cromatografiche impiegate in proteomica.

Modulo “Microscopie Avanzate”

Tratteremo il percorso teorico scientifico che muove i passi dalla microscopia di fluorescenza tridimensionale confocale fino ai recentissimi sviluppi cosiddetti multifotonici. Verrà analizzata la microscopia confocale e la sua evoluzione verso una nuova modalità di eccitazione della fluorescenza, che riveste particolare interesse nello studio di campioni tridimensionali deteriorabili quali cellule e sistemi molecolari.

MODALITA' DIDATTICHE

Lezioni frontali e laboratorio.

PROGRAMMA/CONTENUTO

Modulo “Strumentazione in Genomica e Proteomica”

Strumentazione in Genomica: Sequenziamento del DNA secondo Sanger. Sequenziatori automatizzati con elettroforesi su capillari e loro utilizzazioni estese (analisi di microsatelliti, MLPA, analisi di mosaicismo). Sequenziamento di nuova generazione con diverse piattaforme tecnologiche (Illumina, Roche 454, Ion Torrent e Ion Proton). Analisi cromosomica a livello molecolare (Array-CGH). Cenni di analisi informatica di banche-dati.

Strumentazione in Proteomica: Tecniche di separazione di proteine finalizzate all’analisi proteo mica. Tecniche di ionizzazione in spettrometria di massa (EI, CI, ESI, MALDI). Derivatizzazione di molecole  polari per la successiva analisi in GC-MS finalizzata all’identificazione di specifiche modificazioni post traduzionali (es. glicosilazioni). Analizzatori (quadrupolo, trappola ionica, TOF) e sistemi tandem a più analizzatori. Applicazioni della spettrometria all’analisi proteo mica: PMF, MS/MS, “sequenza de novo”.

Tecniche Cromatografiche:

1. Preparazione del campione.

2. Purificazione di proteine.

3. Tecniche cromatografiche ed elettroforetiche.

4. TCL , cromatografia liquida e gassosa.

5. Parametri cromatografici.

6. Ottimizzazione di un metodo cromatografico.

Modulo “Microscopie Avanzate”

Microscopia ottica in fluorescenza confocale per la visualizzazione e analisi di sistemi biologici a livello cellulare e molecolare in 2D e 3D. Rivelazione di singole molecole con enfasi su proteine fluorescenti (classe GFP; Dsred e fotoattivabili). Metodi F: FRET e FLIM. Sessioni sperimentali su sistemi Nikon e Leica Microsystems.

TESTI/BIBLIOGRAFIA

Modulo “Strumentazione in Genomica e Proteomica”:

Prof. Gianluca Damonte:  Dispense distribuite dal docente.

Prof. Roberro Ravazzolo: Materiale fornito dal docente. Genetica Molecolare Umana, autori T. Strachan, A. Read. Zanichelli.

Prof.ssa Paola Rivaro: Skoog Leary, Chimica Analitica Strumentale, Edises. Materiale fornito a lezione e/o disponibile su Aulaweb.

Modulo “Microscopie Avanzate”: Dispense distribuite dal docente.

DOCENTI E COMMISSIONI

Commissione d'esame

GIANLUCA DAMONTE (Presidente)

ALBERTO GIOVANNI DIASPRO

ROBERTO RAVAZZOLO

PAOLA FRANCESCA RIVARO

LEZIONI

INIZIO LEZIONI

1 Marzo 2017.

Orari delle lezioni

STRUMENTAZIONE IN GENOMICA E PROTEOMICA E MICROSCOPIE AVANZATE

ESAMI

MODALITA' D'ESAME

Orale.

MODALITA' DI ACCERTAMENTO

Esame orale volto alla valutazione del grado di apprendimento dello studente nell’ambito del corso specifico e dei corsi correlati/affini precedentemente seguiti dallo studente.